AlphaFold는 아미노산 서열만으로 단백질의 3차원 구조를 예측해 50년 난제를 풀었고, AlphaFold3는 단백질-리간드 상호작용까지 확장했습니다.단백질이 어떻게 접히는지 예측하는 문제는 생물학에서 50년 가까이 풀리지 않은 숙제였습니다. 단백질의 아미노산 서열은 쉽게 읽을 수 있지만, 그 서열이 어떤 3차원 모양으로 접히는지는 별개의 문제였기 때문입니다. 모양을 모르면 기능을 알 수 없고, 기능을 모르면 신약도 효소도 설계하기 어렵습니다. 그런데 2020년 DeepMind의 AlphaFold2가 이 문제를 사실상 해결하면서 구조생물학의 판도가 바뀌었습니다. 2024년에는 그 공로로 노벨 화학상까지 수여됐습니다. 이 글에서는 AlphaFold가 정확히 무엇을 풀었고, AlphaFold3로 어디까지..